مهم است که به طور منظم فیلترهای استخر خود را تمیز کنید تا از گرفتگی و بی اثر شدن آنها جلوگیری کنید. بسته به اندازه استخر و میزان استفاده از آن، ممکن است لازم باشد FilterBall های خود را هر چند بار یک بار در هفته یا حداقل یک بار در ماه تمیز کنید. برای تمیز کردن FilterBall های خود، به سادگی آن ها را از فیلتر خارج کرده و با شلنگ بشویید.
همچنین می توانید آنها را در یک سطل آب صابون خیس کنید تا کاملا تمیز شوند. قبل از قرار دادن مجدد توپ ها در فیلتر، حتما صابون را کاملا بشویید.